简介 ：开场由警官驱车追捕两个抢超市的罪犯，佐藤美和子警官用高超的驾驶技术迫使罪犯的汽车翻车，当问及作案动机时，罪犯吐出在神海岛上有“Jolly Roger”。 而柯南他们前往位于太平洋中的美丽小岛“神海岛”渡假。这座岛屿自古流传着一则有关于沉没在海底的古代遗迹“海底宫殿”，以及300年前实际存在的女海盗“安·宝尼”、“玛丽·丽德”所遗留下来的宝藏传说。 在毛利小五郎的带领下，小五郎、小兰、园子、阿笠博士、少年侦探团一行人来到神海岛。小兰与园子在海底宫殿附近海…

简介 ：“我想请你们帮我解决某起事件，但如果你们失败的话……” 在神秘委托人的招待下，小五郎与柯南一行人来到了神奈川县横滨市。一行人受邀来到一座游乐园，没想到却掉入神秘男子所设下的陷阱。小兰、灰原与少年侦探团，也因此落入敌人手中成为人质。时间限制为12个小时，如果不在时间内解开男子所出的谜题，小兰他们身上的炸弹就会爆炸。 “你能了解失去心爱的人，是什么样的心情吗？工藤。” 这名男子居然知道柯南其实就是工藤新一？！这名男子的真正身份，难道是……就在同…

简介 ：在半个月前，八代造船的的船舶设计人八代英人在驾驶时心脏病发，坠落悬崖身亡。不同年代的2个事件，是将豪华客船的乘务员与乘客卷入巨大阴谋的序章。 由于园子的邀请，柯南一行人受邀参与豪华客船“亚芙罗蒂号”的处女航仪式。一行人开心的参观邮轮。一行人开始在船内玩起捉迷藏。可是在捉迷藏进行中时，园子突然被人绑架监禁了起来。透过柯南的推理，平安地救出了园子。但这次，八代造船的社长——八代贵江被人刺杀，会长八代延太郎也失去下落。目暮警官们抵达后开始了搜查…

简介 ：东京、大阪和京都发生杀人事件，三个城市的警方调查后，发现事件中的死者都是盗贼团“源氏萤”的成员，毎人都有一个代名，以《义经》内的传统人物命名。同时间，小五郎应京都寺院的邀请，前往京都调查寺内八年前药师如来佛像盗窃事件。寺院早前得到佛像下落的线索，是一件有不同图案的图画，提供给小五郎，以便尽快寻回佛像。 服部亦因杀人案，前往京都调查事件的真相。期间遇上柯南，两人一起调查两宗事件，发现两宗事件都有共同点，有助解开八年前佛像盗窃事件。在调查期…

简介 ：两年前，10岁的天才少年泽田弘树在完成人工智能后坠楼身亡。 两年后的某一天，众多政商名流来到米花市政大楼。这里正在举行能够一举改变全世界游戏业界价值观的模拟游戏机“茧”的发表会。他们的子女全都受邀参加。玩家可透过这个游戏，进入虚拟世界中，体验实地游玩游戏的快感。结合最先进技术的“茧”，其游戏方式是先进入一部外型酷似蚕茧的大型胶囊，透过电脑操作让游戏者沉睡于历史上曾经发生过事件的年代，并进行挑战的虚拟体验游戏。 柯南、灰原及少年侦探团成员们也…

简介 ：柯南和少年侦探团在参观一座西多摩市新建的“双塔摩天大楼”时，意外的发现了黑暗组织成员琴酒（Gin）。之后就发生了命案。 命案还没结束，共通点是每名死者身边都会留下一个小酒杯。就在柯南和少年侦探团找寻凶手时，琴酒也得知他正在找的叛徒雪莉将在不久之后参加西多摩双子大楼的落成典礼，并准备在典礼上把她暗杀。 在会场上，短暂的黑暗又有一人死亡。现场也留下了同样的小酒杯，暗示凶手和之前的是同一人。就在警方和毛利小五郎追查案件的时候，琴酒引爆了藏在大楼内…

简介 ：柯南用新一的身份在电话不自愿地约会了小兰，陪她看5月3日的午夜场电影，以便请求小兰替他参加森谷帝二教授举办的茶会。柯南为此十分烦恼，不知如何掩饰他变小的事实。目送小兰离开后，柯南接到一个电话，是来历不明的炸弹客挑战柯南！ 少年侦探团收到的引爆遥控飞机、被安装了炸弹并装着小猫的宠物篮，还有东都环状线的五颗炸弹陷阱，大家奋力推理，才及时预防了可能发生的意外。可是，最后被安装了炸弹的地点其实是工藤新一和小兰的约会地点－米花市政大楼！柯南该怎么办…

简介 ：与毛利小五郎有关系的人一个个都遭到不明凶手的袭击。凶手袭击后都会留下一张花色为黑桃的扑克牌，因而警方将凶手指向是曾任赌场荷官且被毛利逮捕的村上丈，但这只是凶手的圈套。凶手透过某些管道得知村上丈善于玩扑克牌，加上村上丈曾经被当时任职刑警的毛利小五郎逮捕，进入米花监狱服刑。凶手先杀害村上丈，并因凶手想要杀害的人名字中都有数字的缘故，遂使用扑克牌行凶嫁祸给村上丈。 后来柯南发现，村上丈是左撇子，而凶手却是右撇子，而故在东京湾的行凶完全不是村上…